التعاون مع المنظمة البحرية الدولية :
بدأ التعاون بين "الهيئة" والمنظمة البحرية الدولية منذ مدة طويلة وقد نتج عنه العديد من الثمار في مجال حماية البيئة البحرية في هذا المسار الملاحي الحيوي ( البحر الأحمر وخليج عدن ) والذي يتميز باحتوائه على نظم بيئية غنية ومتنوعة. وقد كان مشروع فصل المسارات الملاحية في مضيق باب المندب واحداً من أهم الثمار المبكرة لهذا التعاون، حيث تم اعتماد المخطط على الخرائط الملاحية الدولية بعد البحوث والمسوحات التي نفذتها الهيئة بالتنسيق مع المنظمة البحرية الدولية.

وقد كانت المنظمة البحرية الدولية (IMO) حاضرة بفعالية منذ الايام الأولى لافتتاح المركز مظهرة كامل دعمها وخصوصاً من خلال إستشاراتها الفنية وكان المركز بدوره قد أظهر نشاطاً واضحاً في تعاونه مع المنظمة من خلال العديد من المبادرات

وتعتبر الهيئة شريكاً فعالاً للمنظمة البحرية الدولية في مشروع "إدارة مياه التوازن العالمي" والذي يضم ثلاث عشرة دولة من خمس بحار إقليمية، من بينها ثلاث دول من الدول الأعضاء في  الهيئة. يقوم الدكتور محمد بدران رئيس اللجنة الفنية لمركز المساعدات المتبادلة في حالة الطواريء "EMARSGA" بدور المنسقً الإقليمي للمشروع، وقد كانت ورشة العمل الاقليمية الخاصة بأساسيات مسح الأحياء في الموانيء والتي عقدت في مقر المركز بمدينة الغردقة في جمهورية مصر العربية في مايو 2007 من أول الفعاليات الأساسية في المشروع. كما قام المركز أيضاً بالمشاركة في ورشة  التدريب الإقليمية الخاصة بإدارة مياه التوازن والتي عقدت في عدن بالجمهورية اليمنية في نوفمبر 2008. و يوجد كذلك ضمن فعاليات المشروع الجاري إعدادها ورشة إقليمية عن النواحي القانونية لإدارة مياه التوازن التي سيتم تنظيمها في المركز. كما سيساهم المركز في تنظيم  ورش تدريب وطنية على ادارة مياه التوازن سيتم تقديمها في الدول المشاركة في المشروع ويكون  التدريب باللغة العربية.

في  شهر مارس عام 2008 وقعت "الهيئة" والمنظمة البحرية الدولية IMO مذكرة تفاهم في إطار برنامج التعاون الفني للمنظمة،  تهدف بشكل أساسي إلى حماية البيئة البحرية والساحلية من التلوث الناجم من مصادر بحرية، وتقوم على أساس تعزيز القدرات الفنية ل EMARSGA ودعم أنشطة المركز في دعم  الدول الاعضاء. وقد تم تسمية الدكتور محمد بدران منسقا للبرنامج من طرف الهيئة. وضمت الأنشطة المنفذة خلال العامين 2008 و 2009 بالاضافة إلى ورشة التدريب الاقليمي لإدارة مياه التوان التي نظمت في عدن نوفمبر 2008 مايلي:
ورشة عمل تدريب اقليمية عن خرائط الحساسية في حالات الاستجابة للتلوث بالزيت نفذت  في مقر المركز في مايو 2009
مهمة عمل خاصة باتفاقية ( ماربول ) في اليمن تم البدء بتنفيذها في يوليو 2009 ويجري حاليا متابعتها
ورشة عمل تدريب اقليمية حول المتطلبات المطلوب توفرها في إقليم البحر الأحمر وخليج عدن لتفعيل إعلانهما مناطق خاصة تحت اتفاقية ماربول  وستعقد في مقر المركز بالغردقه في أكتوبر 2009
ورشة عمل تدريب وطنية بالمستوى الثاني لبرنامج IMO في إعداد وتنفيذ خطة الطواريء للتلوث بالزيت، يتم تنفيذها في ديسمبر 2009 في جيبوتي

ويأتي على رأس أنشطة المركز التي تدعم أهداف المنظمه البحرية الدولية وتبرز دور المركز في الإقليم. عدد من الانشطة التي تقوم بشكل رئيسي على مساعدة الدول الأعضاء في تأسيس أو إعادة تأهيل أو تحديث خططهم الوطنية للطواريء البحرية كما يحدث هذا الان في جيبوتي والسودان واليمن. فعلى سبيل المثال مركز جيبوتي والذي تم أنشاؤه في عام 1990 بمباردة مباشرة من المنظمة البحرية الدولية، أجريت عملية تقييم له وقد وجدت جميع المعدات الرئيسة بحالة جيدة وصالحة للاستخدام،  ويجري حاليا الاعداد لورشة عمل سيتم من خلالها إعادة تخزين المعدات ووضع خطة صيانه دوريه لها لضمان جاهزيتها وستقوم جيبوتي بتوفير الموارد البشرية ووضع الإطار القانوني التي تمكنها من تشغيل مركز استجابه فعال للاستجابه لحوادث التلوث بالزيت  من المستوى الثاني.  

الهيئة الإقليمية للمحافظة على بيئة البحر الأحمر وخليج عدن